广西自然资源职业技术学院贯彻落实自治区党委、政府和自然资源厅关于自然资源工作及教育厅关于职业教育工作的方针政策、决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对学院工作的集中统一领导。

广西自然资源职业技术学院下设内设机构：

（一）党政办公室

（二）党委宣传部

（三）教务科研处

（四）学生工作处

（五）组织人事处

（六）招生就业中心

（七）财务处

（八）后勤保卫处

（八）自然资源工程系

（九）机电工程系

（十）商贸管理系

（十一）公共基础部

（十二）思想政治理论教学部

（十三）图文信息中心

（十四）继续教育培训中心

（十五）教育发展与质量管理办公室

（十六）自然资源调查与规划研究院

按有关规定和章程设置的机构：

（一）纪检监察室

（二）团委

（三）工会